La Universidad de Huelva ofrece Programas de Doctorado destinados a formar investigadores en las grandes ramas del conocimiento: Artes y Humanidades, Ciencias, Ciencias Sociales y Jurídicas, Ciencias de la Salud e Ingeniería y Arquitectura.

Estos programas están integrados en el Espacio Europeo de Educación Superior y han sido verificados siguiendo el procedimiento establecido en la legislación vigente.