La Comisión de Investigación es el órgano encargado de velar por el buen funcionamiento de la actividad investigadora y por la excelencia en la evaluación externa de la Universidad de Huelva. Debe mirar también por que los resultados de dicha actividad investigadora se transfieran al tejido social y productivo, y por la adecuada difusión de la investigación y la generación de conocimiento que se realizan en el seno de la Universidad.